一、仪器介绍
空间多组学分析系统GeoMx Digital Spatial Profiler(DSP)结合了组织影像分析和原位定量技术,可实现高通量组织空间原位转录组和蛋白组的检测,在获得高分辨率的样本空间信息的同时,实现高靶标蛋白和全转录组空间原位表达谱的精准获取。
该设备探针作为基因检测和定量手段,探针主要由三个部分组成:
1.与靶基因互补结合的探针序列或与靶蛋白结合的抗体;
2.紫外光可切割分子;
3.用于标记靶基因的DSP barcode。

二、样品要求
新鲜冷冻样本(FF);石蜡样本(FFPE);组织微阵列(TMA)
三、设备优势
1.多靶标
Nanostring的GeoMx Digital Spatial Profiler一天之内可以处理多达20个组织切片样本。每个样本可以包含多达96个蛋白和>1000个RNA 靶物。
2.多组学
如何在同一组织样本中实现多组学研究向来是临床医学的棘手问题。目前市面上现有平台受制于技术,只能进行RNA或者蛋白测定。而GeoMx Digital Spatial Profiler则正好填补了这一空白。它不仅可以一次性测定多达96个蛋白,而且还可以同时进行多过1000个RNA靶物的测定,完美实现多组学研究。
3.高精度
激光激活的精度范围最小为10微米,可达到单细胞水平。因此研究人员可以对极其稀有的细胞群体进行捕获。
4.样本无损
整个操作过程于样本无接触无损伤。同一样本可以重复使用并用于其他实验。
5.弹性选择感兴趣区域(ROI)
由于不同组织的独有特点,研究人员往往在单一载玻片上可能对某一区域特别感兴趣。在保留组织样本完整性的情况下,GeoMx Digital Spatial Profiler可以允许使用者在单张载玻片上根据组织轮廓选取感兴趣区域(Region Of Interest, ROI),甚至选取稀有细胞群体进行分析。
四、应用方向
1.用于肿瘤异质性、肿瘤免疫微环境高分辨率分析;
2.免疫逃逸相关的抑制性因素分析;
3.临床精准医疗方案开发,联合治疗方案分析研究;
4.在切片水平开展多重基因表达及蛋白表达检测分析,可获取多重基因及蛋白表达的空间位置性信息。单张切片同时检测20000重以上基因表达信息,同一张切片可同时挖掘多达570多种蛋白质数字化表达量信息。
放置地点:山东大学趵突泉校区科研综合楼202/219
使用价格:300元/小时。
联系方式:转化医学共享平台,邵老师,0531-88381718
