【预约使用】山东大学校级大型仪器共享管理系统 https://gxpt.sdu.edu.cn/lims/
一、 功能及应用简介
1、 总RNA,基因组DNA完整性质控;
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Total RNA 不同降解程度的Total RNA的RQN值
total RNA检测-RQN应用
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RQN:5.03 RQN:9.8
RNA样本完整性可以通过RQN(RNA Quality Number)来定义完整性
2、二代三代高通量测序样本质控 ,用于检测RIP或CLIP获得的RNA、核酸酶解或超声打断样本、文库样本等
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3、 poly(A)长度测定
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4、检测基因编辑产生的插入或缺失突变(Indel)
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5. 辅助现有qPCR进行快速检测,验证产物结果的特异性
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二、 主要技术指标
1)功能:采用毛细管电泳原理,可应用于DNA、RNA等核酸的电泳分析,能进行全自动的核酸片段大小测定,核酸质控,浓度测定,微卫星分析等;具有蛋白电泳功能;
2)光源:LED光源,高灵敏度的光电倍增管检测;
★3)自动化程度:采用预装式卡夹(包括毛细管,预制胶,染料),即插即用,无须人工制胶、灌胶、上样,整个过程全部由仪器自动来完成;无需人工添加染料,全封闭预装式卡夹,无污染;无需后期更换毛细管模块;
★4)上样形式:灵活,直接兼容普通单个0.2mlPCR管、常规8联管、12联管、96孔微孔板等;可搭配专用微量管,样品管中溶液需求量最低1ul;
★5)可以检测4个样本无需凑样本,可以一次性完成4-96个任意个数样品的检测分析不浪费任何试剂(包括毛细管、胶、染料、缓冲液等一切需要用到的试剂);
6)检测片段范围:15bp-40kb,最大可达165kb;
★7)检测时间:单次电泳时间最快可达1分钟/4个样本;
8)灵敏度:无需对样品进行纯化,可以直接对PCR产物原液进行检测。DNA样品的检测灵敏度可达1pg/ul;
9)样品上样量:小于0.1 ul,最小上样体积可达1-2微升(样本管中的溶液总体积);
10)卡夹:提供预制胶卡夹,适用于DNA高分辨率分析、DNA快速筛查分析、RNA质量控制分析、蛋白检测等应用,质控分析时提供RNA完整性得分RQN值,和DNA完整性评估标准;
★11)分辨率:对<500bp的DNA片段,可达1-4bp的分辨率,200bp片段可达2bp的分辨率;
12)软件功能:软件可以自动输出电泳胶图、峰图、样品浓度、片段大小等一系列数据,并可以以报告形式完整打印输出; PDF, WORD,JPG都可以输出;
13)无污染:系统中仪器、耗材及检测过程均为全封闭式,避免了核酸染色剂等有害物质与操作人员的接触;
14)可选择通卡夹配件,在仪器外部对卡夹进行通胶,可以对卡夹中毛细管中的胶进行更好的置换,对过期卡夹或者保存不当卡夹进行处理。
15)采用空气压缩机或其他给压装置,操作方便,小巧便于放置和移动,无需氮气钢瓶,无需后期灌气;
16)同时具有英文版本软件和中文版本软件;
★17)仪器集成触摸操控面板,可直接操作软件及分析数据,无需额外连接操控电脑。
18)仪器在运行过程中可随时对已检测样本进行处理并导出实验结果。
19)配置清单
19.1、主机一台
19.2、分析软件一套
19.3、1个预制胶卡夹试剂盒
19.4、DNA Alignment Marker 1支
19.5、DNA SIZE Marker 1 支
19.6、缓冲液试剂一套
三、 管理服务时间
周一至周五上班时间,如有问题可联系设备管理员或随时在设备管理群反馈。
四、 设备使用管理
设备全天开放使用,在校内和校外范围内开放共享(需联系设备管理员开通门禁权限)。
使用者必须先参加操作培训,上机操作考核合格后方可获得使用权限。使用前需在山东大学校级大型仪器共享管理系统官网(https://gxpt.sdu.edu.cn/lims/)预约使用,使用结束后及时进行使用情况登记。管理员根据具体情况,定期组织培训和上机考核。
如有使用需求的师生可联系管理员进入仪器管理工作群,及时了解和交流仪器使用相关信息。
五、 厂家负责人员联系方式
陈飞 15824137637
李娇 13738038137
六、 操作视频或使用指导
见附件
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